Betrachten wir mal die Erscheinung und Fähigkeiten der Mains und Vergleichen sie mit den Clans, würde sich folgendes ergeben:

Feuer - Uchiha (Feuertechniken und Genjutsu)

Wind - Namikaze (Haarfarbe, Rasengan und Eremitenkunst)

Blitz - Hatake (Haarfarbe+Frisur, guter Schwertkämpfer)

Erde - Senju (Mokuton)/Sarutobi (Ähnliche Statur wie Asuma [Erinnert eher an Juugo, aber von ihm ist nicht bekannt wo er herkommt])

Wasser -?? (Sie vereint Fähigkeiten von Shizune, Tsunade und Tobirama, und hat einen Juin-Bonus

Wie man sieht lassen sich wirklich nur 2 von den 5 Mains eindeutig einem Clan zuordnen.

Sich beliebig einen Clan anschließen zu können, wäre allerdings nicht wirklich logisch.
Beispiel durch Heirat: Sakura Uchiha (wird nie ein Sharingan erhalten, außer man pfanzt ihr eines ein)