Es gibt keine Position zweimal auf der Karte! Das Koordinatensystem hat seinen Nullpunkt oben links. Die erste Koordinate gibt die Breite an, die zweite Koordinate die Höhe.
Da du den Ame-Gakure Genin nicht sofort gefunden hast liegt vielmehr dadran, dass dieser nicht statisch ist, sondern auf der Karte herumläuft ¯\_(ツ)_/¯